《黑客帝国动画版》由9段以《黑客帝国》系列电影世界观为基础生发出的短片组成，各篇的角度与风格各异，制作班底汇聚了日本、美国、韩国三地的动画精英。《机器复兴》讲述了MATRIX的历史。机器人不堪人类恶劣对待，终于反抗并将人类化为能源。《少年故事》讲述一名少年突然收到来自网络的召唤，而大批黑衣人开始对他展开围捕。《虚拟程序》展示了一对男女在虚拟训练程序中的片断。《世界纪录》描写一位短跑运动员在接近突破人类极限时终被系统牢牢控制。《超越极限》叙述因为系统错误，平静的街区中出现了一片超常区域。《侦探故事》描写一位侦探被步步引领着试图摆脱系统的桎梏。《矩阵化》讲述一只机器人被人类捕获并驯化的故事。《终极战役》记录了一艘飞船毁灭的经过。
演员：布莱思·丹纳 David Errigo Jr. 萨顿·福斯特 Ashlyn Madden Iris Menas Iara Nemirovsky 拉瑞恩·纽曼 Tyler Shamy
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演员：史蒂文·元 吴珊卓 J·K·西蒙斯 沃尔顿·戈金斯 塞斯·罗根 吉莉安·雅各布斯 杰森·曼楚克斯 莎姬·贝兹 格蕾·德丽斯勒 扎克瑞·昆图 克里斯·迪亚曼托普洛斯 罗斯·马昆德 卡里·佩顿 安德鲁·兰内斯 凯文·迈克尔·理查德森 本·施瓦茨 克兰西·布朗 杰·费罗尔 马克·哈米尔 玛莱斯·裘
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演员：劳拉·贝莉 亚德里安·帕斯达 特罗伊·贝克 邦坡尔·罗宾逊 罗杰·克莱格·史密斯 弗雷德·塔特西奥 特拉维斯·威林厄姆 大卫·卡耶 连姆·奥布赖恩 查尔斯·阿德勒
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